基质辅助激光解吸/电离MALDI是一种独特的技术，允许整个分子的解吸和电离，这与更传统的电离技术不同，后者通常会导致目标物种的大量碎裂。最初，将样品与选定的基质（例如α-氰基-4-羟基肉桂酸）混合并沉积在靶板上。该板被来自脉冲激光的光子轰击，导致基质解吸和电离。随后，能量从基质转移到样品分子。这种温和的能量转移过程使样品分子完好无损，但现在处于气相，产生质子化/阳离子化或去质子化/阴离子化的分子离子。

使用飞行时间质谱仪（ToF MS）分析离子。使用这种技术，离子的质量是通过根据离子的质量/电荷（m/z）比率及时分离离子来确定的。在ToF MS中进行整个质量范围的扫描以获得完整的质谱。ToF MS能够高精度地测定离子的分子量。在大多数情况下，获得特定分子的质量不足以进行唯一鉴定。获取此信息的途径是串联质谱（MS/MS或ToF/ToF）。首先，分离选定的离子并随后碎裂。然后在第二个ToF质谱仪中分离母离子和碎片离子，产生碎片图案，形成目标分子的特征指纹。

MALDI理想用途

    ◆ 准确的分子量测量

    ◆ 样品鉴定 

    ◆ 样品纯度的测定 

    ◆ 氨基酸取代的验证 

    ◆ 翻译后修饰的验证 

    ◆ 反应监测

    ◆ 酶反应 

    ◆ 化学改性 

    ◆ 蛋白质消化 

    ◆ 氨基酸和寡核苷酸测序

    ◆ 氨基酸序列的确认 

    ◆ 肽的从头表征 

    ◆ 通过使用蛋白水解片段中的序列“标签”进行数据库搜索来鉴定蛋白质 

    ◆ 寡核苷酸的表征或质量控制 

    ◆ 蛋白质结构

    ◆ 通过 H/D 交换监测蛋白质折叠 

    ◆ 生理条件下蛋白质-配体复合物的形成 

    ◆ 大分子结构测定 

    ◆ 细菌和真菌鉴定

          ◆ 细菌和真菌分离株的鉴定

    ◆ 化合物在生物组织或非生物系统中的空间分布  

MALDI优势强项

• ◆ 快速、灵敏、高质量精度高、高通量 

MALDI缺点限制

• ◆ 软电离不适用于所有分子。宽多分散性聚合物的质量判别

MALDI技术规格

• 获得的信息：

    各组分的组成、分子量和结构信息 

    定性和（半）定量 

• 样品类型： 固体或液体（溶于水性缓冲液或溶剂，如DMF或DCM） 

• 质量范围：50 – 100000 g/mol 

• 质量精度：

    0.1% （1000 ppm） 质量  

    > 4000 克/摩尔 

    0.005% （50 ppm） 或更好的质量数 

    < 4000 克/摩尔 

    MS/MS 模式下为 50×10-3 g/mol 

• 质量灵敏度： 依赖于钴和矩阵  

• 横向分辨率（成像）：20 x 20 μm